Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rbp2Q08652 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp2Q08652 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp2Q08652 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms