Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn1Q08091 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn1Q08091 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms