Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms