Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cntn3Q07409 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cntn3Q07409 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms