Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Siah1bQ06985 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms