Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Atf4Q06507 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atf4Q06507 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms