Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PtprgQ05909 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PtprgQ05909 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PtprgQ05909 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PtprgQ05909 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PtprgQ05909 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PtprgQ05909 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PtprgQ05909 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PtprgQ05909 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PtprgQ05909 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PtprgQ05909 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PtprgQ05909 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PtprgQ05909 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PtprgQ05909 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtprgQ05909 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtprgQ05909 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtprgQ05909 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtprgQ05909 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtprgQ05909 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtprgQ05909 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtprgQ05909 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtprgQ05909 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtprgQ05909 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PtprgQ05909 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms