Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Fmn1Q05860 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Fmn1Q05860 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Fmn1Q05860 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Fmn1Q05860 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Fmn1Q05860 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Fmn1Q05860 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Fmn1Q05860 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Fmn1Q05860 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Fmn1Q05860 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Fmn1Q05860 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Fmn1Q05860 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Fmn1Q05860 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Fmn1Q05860 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Fmn1Q05860 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Fmn1Q05860 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Fmn1Q05860 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Fmn1Q05860 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Fmn1Q05860 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Fmn1Q05860 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Fmn1Q05860 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Fmn1Q05860 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Fmn1Q05860 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Fmn1Q05860 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Fmn1Q05860 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Fmn1Q05860 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Fmn1Q05860 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Fmn1Q05860 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Fmn1Q05860 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Fmn1Q05860 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Fmn1Q05860 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Fmn1Q05860 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Fmn1Q05860 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Fmn1Q05860 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Fmn1Q05860 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Fmn1Q05860 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Fmn1Q05860 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Fmn1Q05860 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Fmn1Q05860 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Fmn1Q05860 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Fmn1Q05860 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Fmn1Q05860 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Fmn1Q05860 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Fmn1Q05860 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Fmn1Q05860 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Fmn1Q05860 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Fmn1Q05860 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Fmn1Q05860 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Fmn1Q05860 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Fmn1Q05860 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Fmn1Q05860 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Fmn1Q05860 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Fmn1Q05860 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Fmn1Q05860 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Fmn1Q05860 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Fmn1Q05860 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Fmn1Q05860 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Fmn1Q05860 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Fmn1Q05860 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Fmn1Q05860 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Fmn1Q05860 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Fmn1Q05860 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Fmn1Q05860 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Fmn1Q05860 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Fmn1Q05860 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Fmn1Q05860 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Fmn1Q05860 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Fmn1Q05860 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Fmn1Q05860 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Fmn1Q05860 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Fmn1Q05860 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Fmn1Q05860 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Fmn1Q05860 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Fmn1Q05860 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Fmn1Q05860 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Fmn1Q05860 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Fmn1Q05860 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Fmn1Q05860 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Fmn1Q05860 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Fmn1Q05860 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Fmn1Q05860 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Fmn1Q05860 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Fmn1Q05860 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Fmn1Q05860 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Fmn1Q05860 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Fmn1Q05860 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Fmn1Q05860 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Fmn1Q05860 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Fmn1Q05860 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Fmn1Q05860 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Fmn1Q05860 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Fmn1Q05860 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Fmn1Q05860 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Fmn1Q05860 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Fmn1Q05860 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Fmn1Q05860 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Fmn1Q05860 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Fmn1Q05860 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Fmn1Q05860 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Fmn1Q05860 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms