Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoc2Q05020 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoc2Q05020 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms