Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox10Q04888 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox10Q04888 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms