Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Thbs2Q03350 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Thbs2Q03350 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms