Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mmp11Q02853 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mmp11Q02853 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Mmp11Q02853 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mmp11Q02853 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mmp11Q02853 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mmp11Q02853 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mmp11Q02853 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mmp11Q02853 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mmp11Q02853 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mmp11Q02853 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mmp11Q02853 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mmp11Q02853 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mmp11Q02853 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mmp11Q02853 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mmp11Q02853 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mmp11Q02853 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Mmp11Q02853 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mmp11Q02853 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mmp11Q02853 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms