Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gjb4Q02738 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gjb4Q02738 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms