Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col1a2Q01149 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col1a2Q01149 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col1a2Q01149 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col1a2Q01149 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col1a2Q01149 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col1a2Q01149 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col1a2Q01149 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col1a2Q01149 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col1a2Q01149 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col1a2Q01149 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col1a2Q01149 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col1a2Q01149 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col1a2Q01149 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col1a2Q01149 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col1a2Q01149 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col1a2Q01149 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col1a2Q01149 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col1a2Q01149 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col1a2Q01149 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col1a2Q01149 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col1a2Q01149 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col1a2Q01149 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col1a2Q01149 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col1a2Q01149 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col1a2Q01149 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Col1a2Q01149 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Col1a2Q01149 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Col1a2Q01149 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Col1a2Q01149 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col1a2Q01149 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col1a2Q01149 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col1a2Q01149 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col1a2Q01149 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col1a2Q01149 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col1a2Q01149 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col1a2Q01149 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms