Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gjb2Q00977 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms