Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VegfaQ00731 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms