Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SeleQ00690 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SeleQ00690 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SeleQ00690 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SeleQ00690 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SeleQ00690 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SeleQ00690 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SeleQ00690 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SeleQ00690 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SeleQ00690 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SeleQ00690 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SeleQ00690 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SeleQ00690 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SeleQ00690 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SeleQ00690 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SeleQ00690 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SeleQ00690 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SeleQ00690 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SeleQ00690 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SeleQ00690 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SeleQ00690 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SeleQ00690 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SeleQ00690 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SeleQ00690 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SeleQ00690 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SeleQ00690 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SeleQ00690 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SeleQ00690 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SeleQ00690 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SeleQ00690 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SeleQ00690 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SeleQ00690 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms