Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms