Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx2Q00262 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx2Q00262 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms