Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cds1P98191 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cds1P98191 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cds1P98191 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cds1P98191 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms