Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VegfdP97946 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VegfdP97946 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VegfdP97946 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VegfdP97946 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VegfdP97946 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VegfdP97946 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VegfdP97946 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VegfdP97946 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VegfdP97946 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VegfdP97946 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms