Protein–RNA interactions for Protein: P97436

Nkx3-1, Homeobox protein Nkx-3.1, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx3-1P97436 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkx3-1P97436 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkx3-1P97436 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkx3-1P97436 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkx3-1P97436 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkx3-1P97436 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkx3-1P97436 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkx3-1P97436 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkx3-1P97436 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkx3-1P97436 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkx3-1P97436 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkx3-1P97436 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkx3-1P97436 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkx3-1P97436 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkx3-1P97436 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkx3-1P97436 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkx3-1P97436 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nkx3-1P97436 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nkx3-1P97436 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nkx3-1P97436 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nkx3-1P97436 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nkx3-1P97436 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nkx3-1P97436 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Nkx3-1P97436 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Nkx3-1P97436 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nkx3-1P97436 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nkx3-1P97436 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nkx3-1P97436 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nkx3-1P97436 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nkx3-1P97436 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nkx3-1P97436 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nkx3-1P97436 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nkx3-1P97436 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms