Protein–RNA interactions for Protein: P97363

Sptlc2, Serine palmitoyltransferase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc2P97363 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptlc2P97363 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sptlc2P97363 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms