Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx1P81068 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx1P81068 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx1P81068 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx1P81068 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.8 ms