Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otx2P80206 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otx2P80206 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otx2P80206 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otx2P80206 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Otx2P80206 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otx2P80206 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otx2P80206 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Otx2P80206 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Otx2P80206 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Otx2P80206 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otx2P80206 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otx2P80206 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otx2P80206 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms