Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx1P80205 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx1P80205 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otx1P80205 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Otx1P80205 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms