Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CiitaP79621 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CiitaP79621 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CiitaP79621 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CiitaP79621 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CiitaP79621 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CiitaP79621 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CiitaP79621 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CiitaP79621 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms