Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxb13P70321 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxb13P70321 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxb13P70321 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxb13P70321 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxb13P70321 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxb13P70321 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxb13P70321 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxb13P70321 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxb13P70321 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxb13P70321 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxb13P70321 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxb13P70321 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxb13P70321 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxb13P70321 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxb13P70321 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxb13P70321 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxb13P70321 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxb13P70321 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxb13P70321 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxb13P70321 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxb13P70321 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxb13P70321 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxb13P70321 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxb13P70321 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxb13P70321 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms