Protein–RNA interactions for Protein: P70269

Ctse, Cathepsin E, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtseP70269 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtseP70269 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtseP70269 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtseP70269 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtseP70269 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtseP70269 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtseP70269 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtseP70269 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtseP70269 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtseP70269 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtseP70269 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtseP70269 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtseP70269 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtseP70269 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtseP70269 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtseP70269 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtseP70269 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtseP70269 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtseP70269 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtseP70269 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtseP70269 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtseP70269 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CtseP70269 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtseP70269 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtseP70269 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtseP70269 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtseP70269 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtseP70269 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtseP70269 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtseP70269 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtseP70269 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtseP70269 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtseP70269 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtseP70269 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtseP70269 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CtseP70269 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtseP70269 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtseP70269 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtseP70269 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtseP70269 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtseP70269 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtseP70269 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtseP70269 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtseP70269 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtseP70269 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtseP70269 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtseP70269 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtseP70269 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtseP70269 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtseP70269 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtseP70269 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtseP70269 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtseP70269 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtseP70269 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtseP70269 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtseP70269 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtseP70269 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtseP70269 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtseP70269 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtseP70269 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtseP70269 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtseP70269 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtseP70269 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtseP70269 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtseP70269 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtseP70269 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtseP70269 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtseP70269 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtseP70269 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CtseP70269 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtseP70269 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtseP70269 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtseP70269 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtseP70269 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtseP70269 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtseP70269 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtseP70269 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtseP70269 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtseP70269 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtseP70269 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtseP70269 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtseP70269 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtseP70269 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtseP70269 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtseP70269 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CtseP70269 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtseP70269 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtseP70269 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtseP70269 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CtseP70269 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtseP70269 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtseP70269 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtseP70269 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtseP70269 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtseP70269 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtseP70269 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CtseP70269 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtseP70269 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtseP70269 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtseP70269 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms