Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkcbP68404 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkcbP68404 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkcbP68404 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkcbP68404 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkcbP68404 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkcbP68404 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkcbP68404 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkcbP68404 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkcbP68404 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkcbP68404 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkcbP68404 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkcbP68404 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkcbP68404 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkcbP68404 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkcbP68404 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkcbP68404 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkcbP68404 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkcbP68404 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkcbP68404 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PrkcbP68404 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PrkcbP68404 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms