Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Acta1P68134 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acta1P68134 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acta1P68134 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acta1P68134 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acta1P68134 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acta1P68134 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acta1P68134 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acta1P68134 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Acta1P68134 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acta1P68134 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acta1P68134 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Acta1P68134 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acta1P68134 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms