Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vsnl1P62761 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Vsnl1P62761 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms