Protein–RNA interactions for Protein: P62702

Rps4x, 40S ribosomal protein S4, X isoform, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps4xP62702 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps4xP62702 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rps4xP62702 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps4xP62702 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps4xP62702 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps4xP62702 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms