Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms