Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga11P61622 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga11P61622 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itga11P61622 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itga11P61622 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itga11P61622 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itga11P61622 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itga11P61622 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Itga11P61622 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itga11P61622 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms