Protein–RNA interactions for Protein: P61092

Siah1a, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1A, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1aP61092 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Siah1aP61092 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Siah1aP61092 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Siah1aP61092 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Siah1aP61092 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Siah1aP61092 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Siah1aP61092 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Siah1aP61092 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Siah1aP61092 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Siah1aP61092 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Siah1aP61092 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Siah1aP61092 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Siah1aP61092 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Siah1aP61092 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Siah1aP61092 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Siah1aP61092 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Siah1aP61092 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Siah1aP61092 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Siah1aP61092 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Siah1aP61092 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Siah1aP61092 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Siah1aP61092 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Siah1aP61092 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Siah1aP61092 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Siah1aP61092 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Siah1aP61092 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Siah1aP61092 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Siah1aP61092 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Siah1aP61092 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Siah1aP61092 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Siah1aP61092 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Siah1aP61092 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Siah1aP61092 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Siah1aP61092 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Siah1aP61092 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Siah1aP61092 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Siah1aP61092 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Siah1aP61092 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Siah1aP61092 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Siah1aP61092 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Siah1aP61092 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Siah1aP61092 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Siah1aP61092 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Siah1aP61092 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Siah1aP61092 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Siah1aP61092 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Siah1aP61092 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Siah1aP61092 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Siah1aP61092 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Siah1aP61092 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Siah1aP61092 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Siah1aP61092 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Siah1aP61092 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Siah1aP61092 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms