Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms