Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CgnP59242 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CgnP59242 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CgnP59242 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CgnP59242 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CgnP59242 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CgnP59242 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CgnP59242 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CgnP59242 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CgnP59242 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CgnP59242 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CgnP59242 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CgnP59242 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CgnP59242 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CgnP59242 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CgnP59242 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CgnP59242 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CgnP59242 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CgnP59242 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CgnP59242 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CgnP59242 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CgnP59242 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CgnP59242 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CgnP59242 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CgnP59242 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CgnP59242 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CgnP59242 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CgnP59242 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CgnP59242 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CgnP59242 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CgnP59242 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CgnP59242 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CgnP59242 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CgnP59242 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CgnP59242 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CgnP59242 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CgnP59242 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CgnP59242 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CgnP59242 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CgnP59242 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CgnP59242 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CgnP59242 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CgnP59242 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CgnP59242 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CgnP59242 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CgnP59242 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CgnP59242 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CgnP59242 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CgnP59242 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CgnP59242 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CgnP59242 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CgnP59242 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CgnP59242 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CgnP59242 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CgnP59242 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CgnP59242 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CgnP59242 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CgnP59242 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CgnP59242 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CgnP59242 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CgnP59242 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CgnP59242 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CgnP59242 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CgnP59242 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CgnP59242 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CgnP59242 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CgnP59242 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CgnP59242 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CgnP59242 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CgnP59242 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CgnP59242 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CgnP59242 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CgnP59242 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CgnP59242 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CgnP59242 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CgnP59242 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CgnP59242 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CgnP59242 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CgnP59242 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CgnP59242 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CgnP59242 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CgnP59242 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CgnP59242 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CgnP59242 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CgnP59242 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CgnP59242 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CgnP59242 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CgnP59242 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CgnP59242 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CgnP59242 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CgnP59242 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CgnP59242 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CgnP59242 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CgnP59242 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CgnP59242 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CgnP59242 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CgnP59242 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CgnP59242 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CgnP59242 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CgnP59242 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms