Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Scarf2P59222 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms