Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snrpa1P57784 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Snrpa1P57784 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms