Protein–RNA interactions for Protein: P56873

Sssca1, Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sssca1P56873 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sssca1P56873 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sssca1P56873 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms