Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pdcd5P56812 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdcd5P56812 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.3 ms