Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms