Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acod1P54987 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Acod1P54987 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acod1P54987 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acod1P54987 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acod1P54987 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acod1P54987 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acod1P54987 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Acod1P54987 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acod1P54987 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms