Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cacnb3P54285 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms