Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab2aP53994 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab2aP53994 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab2aP53994 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab2aP53994 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab2aP53994 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab2aP53994 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab2aP53994 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab2aP53994 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab2aP53994 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab2aP53994 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab2aP53994 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab2aP53994 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab2aP53994 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab2aP53994 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab2aP53994 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab2aP53994 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab2aP53994 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab2aP53994 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab2aP53994 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms