Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ApodP51910 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ApodP51910 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ApodP51910 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ApodP51910 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ApodP51910 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ApodP51910 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ApodP51910 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ApodP51910 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ApodP51910 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ApodP51910 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ApodP51910 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ApodP51910 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ApodP51910 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ApodP51910 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ApodP51910 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ApodP51910 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ApodP51910 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ApodP51910 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ApodP51910 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ApodP51910 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ApodP51910 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ApodP51910 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ApodP51910 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ApodP51910 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ApodP51910 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ApodP51910 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ApodP51910 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ApodP51910 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ApodP51910 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ApodP51910 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ApodP51910 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ApodP51910 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ApodP51910 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ApodP51910 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ApodP51910 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ApodP51910 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ApodP51910 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ApodP51910 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ApodP51910 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ApodP51910 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ApodP51910 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ApodP51910 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ApodP51910 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ApodP51910 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ApodP51910 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ApodP51910 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ApodP51910 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ApodP51910 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ApodP51910 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ApodP51910 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ApodP51910 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ApodP51910 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ApodP51910 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ApodP51910 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ApodP51910 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ApodP51910 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ApodP51910 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ApodP51910 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ApodP51910 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ApodP51910 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ApodP51910 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ApodP51910 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ApodP51910 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ApodP51910 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ApodP51910 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ApodP51910 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ApodP51910 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ApodP51910 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ApodP51910 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ApodP51910 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ApodP51910 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ApodP51910 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ApodP51910 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ApodP51910 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ApodP51910 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ApodP51910 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ApodP51910 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ApodP51910 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ApodP51910 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ApodP51910 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ApodP51910 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ApodP51910 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ApodP51910 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ApodP51910 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ApodP51910 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ApodP51910 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ApodP51910 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ApodP51910 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ApodP51910 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ApodP51910 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ApodP51910 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ApodP51910 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ApodP51910 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ApodP51910 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ApodP51910 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ApodP51910 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ApodP51910 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ApodP51910 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ApodP51910 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms