Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn1swP51491 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn1swP51491 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.5 ms