Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FanccP50652 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FanccP50652 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FanccP50652 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FanccP50652 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FanccP50652 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FanccP50652 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FanccP50652 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FanccP50652 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FanccP50652 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FanccP50652 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FanccP50652 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FanccP50652 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FanccP50652 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FanccP50652 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FanccP50652 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FanccP50652 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FanccP50652 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FanccP50652 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FanccP50652 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FanccP50652 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FanccP50652 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FanccP50652 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FanccP50652 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FanccP50652 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FanccP50652 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FanccP50652 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FanccP50652 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FanccP50652 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FanccP50652 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FanccP50652 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FanccP50652 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FanccP50652 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FanccP50652 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FanccP50652 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FanccP50652 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FanccP50652 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FanccP50652 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FanccP50652 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FanccP50652 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FanccP50652 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FanccP50652 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FanccP50652 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FanccP50652 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FanccP50652 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FanccP50652 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FanccP50652 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FanccP50652 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FanccP50652 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FanccP50652 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FanccP50652 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FanccP50652 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FanccP50652 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FanccP50652 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FanccP50652 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FanccP50652 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FanccP50652 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FanccP50652 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FanccP50652 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FanccP50652 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FanccP50652 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FanccP50652 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FanccP50652 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FanccP50652 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FanccP50652 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FanccP50652 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FanccP50652 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FanccP50652 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FanccP50652 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FanccP50652 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FanccP50652 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FanccP50652 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FanccP50652 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FanccP50652 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FanccP50652 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FanccP50652 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FanccP50652 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FanccP50652 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FanccP50652 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FanccP50652 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FanccP50652 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FanccP50652 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FanccP50652 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FanccP50652 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FanccP50652 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FanccP50652 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FanccP50652 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FanccP50652 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FanccP50652 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FanccP50652 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FanccP50652 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FanccP50652 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FanccP50652 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FanccP50652 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FanccP50652 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FanccP50652 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FanccP50652 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FanccP50652 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FanccP50652 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FanccP50652 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms