Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FmodP50608 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FmodP50608 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FmodP50608 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FmodP50608 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FmodP50608 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FmodP50608 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FmodP50608 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FmodP50608 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FmodP50608 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FmodP50608 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FmodP50608 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FmodP50608 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FmodP50608 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FmodP50608 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FmodP50608 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FmodP50608 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FmodP50608 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FmodP50608 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FmodP50608 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FmodP50608 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FmodP50608 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FmodP50608 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FmodP50608 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FmodP50608 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FmodP50608 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FmodP50608 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FmodP50608 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FmodP50608 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FmodP50608 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FmodP50608 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FmodP50608 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FmodP50608 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FmodP50608 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FmodP50608 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FmodP50608 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FmodP50608 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FmodP50608 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FmodP50608 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FmodP50608 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FmodP50608 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FmodP50608 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FmodP50608 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FmodP50608 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FmodP50608 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FmodP50608 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FmodP50608 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FmodP50608 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FmodP50608 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FmodP50608 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FmodP50608 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FmodP50608 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FmodP50608 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FmodP50608 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FmodP50608 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FmodP50608 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FmodP50608 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FmodP50608 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FmodP50608 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FmodP50608 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FmodP50608 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FmodP50608 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FmodP50608 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FmodP50608 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FmodP50608 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FmodP50608 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FmodP50608 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FmodP50608 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FmodP50608 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FmodP50608 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FmodP50608 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FmodP50608 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FmodP50608 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FmodP50608 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FmodP50608 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FmodP50608 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FmodP50608 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FmodP50608 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FmodP50608 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FmodP50608 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FmodP50608 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FmodP50608 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FmodP50608 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FmodP50608 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FmodP50608 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FmodP50608 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FmodP50608 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FmodP50608 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FmodP50608 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FmodP50608 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FmodP50608 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FmodP50608 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FmodP50608 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FmodP50608 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FmodP50608 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FmodP50608 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FmodP50608 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FmodP50608 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FmodP50608 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FmodP50608 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms